Prof. Dr. Pratschke ist seit 2014 als Leiter der Klinik für Allgemein-, Viszeral- und Transplantationschirurgie sowie der Klinik für Allgemein-, Viszeral-, Gefäß- und Thoraxchirurgie der Charité Universitätsmedizin Berlin tätig. Er wurde mit zahlreichen deutschen und internationalen Forschungspreisen auf den Gebieten Organtransplantation und Chirurgie ausgezeichnet und hat diverse Vorstandspositionen der Europäischen Gesellschaft für Organtransplantation (ESOT) inne.